Действие аниме-сериала разворачивается в недалёком будущем, когда Землю атакуют загадочные существа, получившие название «Враги человечества». Для защиты от этой угрозы созданы специальные академии, где подростки с уникальными сверхъестественными талантами учатся сражаться. Среди этих избранных есть один совершенно обычный юноша, не обладающий ни малейшей силой.
Действие разворачивается в мире вселенной Sword Art Online спустя несколько лет после событий, когда геймеры пережили кошмар заточения в смертельной игре. В 2027 году на смену популярному устройству виртуальной реальности Амусферу приходит новая разработка — Аугма, позволяющая совмещать цифровой контент с реальным миром через технологию дополненной реальности.