Лукас Рейес, бывший спецагент, чья карьера завершилась из-за проблем с алкоголем, влачит жалкое существование в Бангкоке. Его мрачное затишье нарушает Кэтрин Брант, его бывшая начальница, с отчаянным предложением: на борту пассажирского самолёта, следующего в Сан-Франциско, предположительно летит ценный хакер по кличке Призрак. Задача Лукаса — найти и передачить его американским властям живым.
Действие фильма разворачивается в 2707 году, когда после пробуждения инопланетного механизма, спрятанного под землей с времен Ледникового периода, человечество столкнулось с угрозой полного истребления. Устройство, созданное для трансформации людей в агрессивных мутантов, вышло из-под контроля после того, как солдаты случайно нарушили печати, скреплявшие его корпус.