Фильм «Питер Пэн и Алиса в стране чудес» предлагает удивительную альтернативную предысторию двух культовых персонажей. Прежде чем стать вечным мальчиком-паном и отважной героиней Страны чудес, они были обычными детьми — братом и сестрой, выросшими в семье, где реальность переплеталась с волшебством.
Действие фильма разворачивается в 1927 году, когда пойманный тёмный волшебник Геллерт Грин-де-Вальд совершает эффектный побег и начинает реализацию своего жуткого плана по подчинению мира. Его идеи находят отклик среди магов, разжигая конфликт и раскол в самом сердце волшебного сообщества. Параллельно Альбус Дамблдор, понимая угрозу, тайно просит своего бывшего ученика, зоолога Ньют...