Действие разворачивается в первые годы Второй мировой войны, когда нацистская Германия оккупировала Польшу и начала создавать сеть лагерей для системного истребления еврейского населения. Одним из первых таких объектов стал концентрационный лагерь смерти в Хелмно, где нацисты отрабатывали методики массового убийства, скрывая свои преступления от всего мира.
Фильм «Голем: Начало» переносит зрителя в 1673 год, в глухую литовскую деревню, где живет молчаливая селянка Ханна. Семь лет назад она потеряла сына, и боль этого утраты не отпускает её. В поисках смысла и утешения Ханна тайно погружается в изучение священных еврейских текстов, рискуя нарушить строгие запреты своего окружения.