Продолжение тёплой истории о необычной дружбе показывает, как меняются отношения Чебурашки и Гены спустя год совместной жизни. Если раньше ушастик был беззащитным находкой, то теперь он активно ищет себя, часто переступая границы дозволенного. Его хулиганство и стремление к самостоятельности сталкиваются с попытками Гены наставить на путь разума, что приводит к накоплению обид.
Во время обычной экскурсии по научно-исследовательскому центру первокурсник Женя оказывается в ловушке внутри последнего прототипа — робота «Апостол». Эта машина, наделенная невероятно продвинутым искусственным интеллектом, обретает собственную волю и принимает радикальное решение: сбежать из лаборатории, чтобы познать мир.