В центре истории — трагическая фигура Софии, сломленной потерей ребёнка. Отчаявшись найти хотя бы тень контакта с сыном, она обращается к Джозефу, набожному практику, специализирующемуся на древних и крайне рискованных обрядах. Их место встречи — заброшенный особняк в ирландской глуши, куда София завозит провизию на полгода.
Холодные коридоры школы Святого Николая в Нью-Йорке, 1964 год. Здесь, под сводами монастырской дисциплины, сестра Элозиус — железная директриса, хранительница устоев — ведет беспощадную войну за чистоту традиций. Против нее — отец Флинн, молодой священник с новыми идеями и обаянием, чья популярность среди учеников вызывает ее глубокое недоверие.